介质液体活检:恶性肿瘤早筛 & 微创孕前验测(NIPT)改善策划方案:用于癌症早筛和无创产前检测(NIPT)的完整工作流程解决方案
简介
一、完整的血浆/血清无细胞工作流程
1、cf-DNA /cf-RNA收集与保存管
a. 从血浆/血清中纯化cf-RNA b. 从血浆/血清中纯化cf-DNA2、cf-DNA /c f-RNA研究的实验室指南
3、血浆Small RNA测序,推荐工作流程
4、无创产前检测NIPT,开放平台工作流程
5、权威客户案例
二、完整的尿液无细胞工作流程
1、尿液收集和保存设备(管,杯,桶)
a. 从排尿中提炼cf-RNA b. 从尿液浑浊中导入cf-DNA2、推荐的小RNA测序工作流程
三、文章与出版物
一、简介:
Norgen Biotek 展示完整篇的液状体活检业务方案,包涵样版采摘和存放机 、cf-DNA/cf-RNA/exosomes纯化、小RNA/RNA队列和高等生物学内容学定量分析。欧宝体育官方 的样版永久维持技艺,比较对应血浆、的尿液和口水,在永久维持时光、样版详尽性、搬家和储备还有多分折物永久维持上兼具多个优质。与应用场景矽胶的水平其他,Norgen的专有增碳硅核酸纯化水平被优转化成从其他类型的液體活检中截获太低量的存在核酸,而就不会对存在核酸的字段程度表面担任何侧重性。使用欧宝体育官方 先进性的生物技术内容学讲解道具和效果,特备是在Illumina平桌上的测序方面,Norgen早就办理了来于优秀研究方案单位的异常都具有试练性的子样本。液体活检,作为癌症检测的样本类型
01、非注入性样本量抓取02、符合于查测各个肠癌型号03、给予全面的的异质性消化道疾病讲解04、提供数据团伙动力原则的个人观点05、同意信息的传染性疾病监视器,以监视器趋势中的淋巴肿瘤异质性1、血清/血浆样本收集&保存
CF-DNA/CF - RNA PRESERVATIVE TUBES
cf-DNA/cf-RNA 保存管 (CAT. 63950, D x 639 50)
不含固定剂的防腐剂,无DNA热塑
在室内温度下留存cf-DNA/ct-DNA,30天;37°C下也可以留存8天
在空调温度下保留cf-RNA ,30天
在室温下将循环肿瘤细胞 (CTC) 保留 14 天
车辆/车辆后无血浆余量亏损资金
无细胞的循环DNA和RNA采集与保存 (全血样本)
Figure ♍1.🅠 条件体温存贮对cf-DNA(pDNA)的作用,以短Alu(115bp)片 段实例,并且对基因遗传组DNA(gDNA)的作用,以大Alu(247 bp)电影片段 实例。
欧宝体育官方 信息:
cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes | 用于体外诊断用途 CE-IVD 标志 符合欧盟指令 98/79/EC | |
50 Tubes | Cat. Dx63950 | |
50 Tubes | Cat. 63950 |
a. cf-RNA 提取纯化
PLASMA / SERUM CFC-RNA ADVANCED PURIFICATION KIT
血浆/ 血清 cf-RNA 高级纯化试剂盒(CAT. 68200)
分离提取,所有大小的循环和外泌体RNA,包括microRNA
Fi🍨gure 1. 使用不同的𓃲cfc-RNA纯化方法从K2EDTA血浆中纯化的RNA中 扩增miR-21和miR-16的rt-qPCR。
与使用Q品牌的纯化试剂盒(于二氧化硅的技术)纯化的RNA中扩增相 同的miRNA目标相比,Norgens专利的SiC技术,不论是手动提取和自动 设备提取都更有优势。
欧宝体育官方
信息:
Plasma/Serum cfc-RNA Advanced Purification Kit | |
50 Preps | Cat. 68200 |
PLASMA / SERUM CIRCULATING AND EXOSOMAL RNA
PURIFICATION KITS (SLURRY FORMAT)
血浆/血清无限循环和外泌体 RNA纯化实验试剂盒 (浆料表现形式,适于大至积子样本与DIY) (CAT . 42800 , Dx428 00, 51000 , 5 0900, 29500,足够有差异上样量)从血浆/血清样品中快速简单地分离循环RNA,包括外泌体RNA
Figure 1. 脱离和在线检测各不相同血浆体积的巡环RNA。
Plasma/Serum Circulating and Exosomal RNA Purification Kits (Slurry Format) | ||
50 Preps (Mini) | Cat. 51000 | |
50 Preps | Cat. 42800 | |
50 Preps | Cat. Dx42800 | |
25 Preps(Maxi) | Cat. 50900 | |
1 x 96-Well Plate | Cat. 29500 |
cf-RNA 提取纯化
PLASMA /SERUM RNA PURIFICATION KITS 血浆/血清 RNA 纯化生化试剂盒 (CAT. 55000, 56100, 56200)从血浆/血清样品中快速简单地纯化循环RNA和外泌体RNA
Figure 1. 在检则人類5S转录本和miR-21时,确立血浆RNA样件中产生的 减弱量。Plasma/Serum RNA Purification Kits | |
50 Preps (Mini) | Cat. 55000 |
20 Preps (Midi) | Cat. 56100 |
10 Preps (Maxi) | Cat. 56200 |
PLASMA/SERUM EXOSOME PURIFICATION AND RNA ISOLATION KITS
血浆/ 血清外泌体纯化及RNA提取试剂盒 (CA T. 58300, 58500, 58600)
无酚导入
从血浆和血清样本中纯化外泌体,并提取外泌体中RNA
Figure 1. 一直同的血浆中纯化外泌体,并导入外泌体中RNA。
Norgen的血浆/血清外泌体纯化和RNA分离迷你试剂盒(Cat# 58300)被把他们拿来从♎未同血浆质量的外泌体中分发型离出RNA,运行同 一化学制剂盒。接下来用2 uL脱离的RNA用作RT-qPCR反馈的设计,分析评估脱离的血浆外泌体miR-26a的PCR扩增环境。(A)血浆外泌体 miR-26a随之试样输进量的增添呈非线型上升。(B)血浆外泌体 miR-26a的相对性量界面显示出优൩良的非线型,回笼率少于90%。
欧宝体育官方 描述
Plasma/Serum Exosome Purification and RNA Isolation Kits | |
50 Preps (Mini | Cat. 58300 |
25 Preps (Midi) | Cat. 58500 |
15 Preps (Maxi) | Cat. 58600 |
b.cf-DNA 提取纯化
PLASMA/SERUM CFC- DNA ADVANCED PURIFICATION KIT
血浆/血清 CFC-DNA初级纯化微生物培养基盒(CAT. 68000 )从血浆和血清样品中快速简单地纯化各种大小的 CFC-DNA 和 CT-DNA
欧宝体育官方 信息:
Plasma/Serum CFC-DNA Advanced Purification Kit | |
50 Preps | Cat. 68000 |
PLASMA /SERUM CIRCULATING DNA PURIF I C A TION KITS ( SLURRY FORMAT)
血浆/血清再循环DNA纯化免疫试剂盒(料浆类型,适大至积样本量与DIY) (CA T. 5060 0, 5 1200, 513 00)从血浆/血清样品中快速简单地分离循环DNA
Figure 1. 从0.5 mL和2 mL血浆中测试人体5S什么是基因。欧宝体育官方 信息:
Plasma/Serum Circulating DNA Purification Kits (Slurry Format) | |
50 Preps (Mini) | Cat. 50600 |
20 Preps (Midi) | Cat. 51200 |
10 Preps (Maxi) | Cat. 51300 |
cf-DNA 提取纯化
PLASMA/SERUM CELL-FREE CIRCULATING DNA PURIFICATION KITS
血浆/ 血清无上皮细胞循环往复DNA纯化免疫试剂盒 (CAT. 55500, D x 55500, 55100, D x 55100, 55600, D x 55600, 55800, D x 55800)从血浆和血清样品中快速简单地纯化各种大小的循环DNA
Figure 1. 从用青金桔酸盐用作抗凝剂搜集的50 uL、100 🦄uL和200 uL血浆中纯化游离于DNA,并与Q有限公司的化学制剂盒参与相当。
Plasma/Serum Cell-Free Circulating DNA Purification Kits | ||
50 Preps (Micro) | Cat. 55500 | |
50 Preps (Micro) | Cat. Dx55500 | |
50 Preps (Mini) | Cat. 55100 | |
50 Preps (Mini) | Cat. Dx55100 | |
20 Preps (Midi) | Cat. 55600 | |
20 Preps (Midi) | Cat. Dx55600 | |
10 Preps (Maxi) | Cat. 55800 | |
10 Preps (Maxi) | Cat. Dx55800 |
2、cf-DNA/cf-RNA 研究的实验室指南
介绍
无神经元理论学习分析具备一款多种单纯、周到性且非侵蚀性的检测和理论学习分析最简单的具体方法。利用录入一款快速的的静脉血子样本,理论学习分析人群可不可以检测 恶性肿瘤,体现了未诞生宝宝的特色,还辨别的患病者的大部分遗传病出错。传统艺术最简单的具体方法如活检是非常痛苦且侵蚀性的,但会很有可能会对 患病者对其通过不正确的检测或致使更具的损伤。要想关心您在cf-DNA / cf-RNA理论学习分析中可以获得较大 投资回报,本自动化书具备了试验台指 南,以有效确保正确的最终。从食用欧宝体育官方 的cf-DNA / cf-RNA保持管对其通过录入和搬运到核酸的纯化,竟然以及量测和测序等 在下游用途,Norgen为您的运作过程的每种步具备周到性的克服方案设计。样本采集和保存
致使血浆模板中cf-DNA和cf-RNA(总称为无癌细胞酸或cf-NA)的酸度较低(1-100 pg/μL),个人建议一方面确立是需要备考的血 粘液积。而且获得模板,好一个采用无须依赖感EDTA或肝素的血获得管(BCT),而且这二者管都不将会在高出18天 的时内稳定模板,还有就是将会会串扰上游app。不仅,若是以常温(RT)输送,在EDTA或肝素分液漏斗获得的血将始于 溶血,然而不是合采取cf-NA设计。若是不存在保护措施管,应在获得后不高出1天离心法收旧血浆,并在价格区间前将其吸收 在-70°C的干冰面。若是采用了cf保持管,则不是需要注重这一个。Figure 1. Norgen的cf-DNA/cf-RNA防蚀管、行业竞品的试管和 EDT💦A单管直接的猩红素降解率会比较。猩红素是血癌组织细胞裂解的一款 较好的指标值,根据它在癌组织细胞自杀时被解释放弄出来来,并更具有趣的吸光度等值线。
样本定量和质量确定
NanoDrop? 议器不常用做评估报告格式血浆中cf-DNA和cf-RNA的重量和数量统计,而且其测验域值为5 ng/μL,比血浆中cf-NA浓 度大出50到5000倍。的使用Bioanalyzer设定好的RNA全部性参数值(RIN)也被除掉当做重量设定好的方式方法,而且它依赖性于细 胞RNA,中应是18S和28S rRNA。若范本量所经相应的治理 和提供,这2个标出物都最好不要产生。若产生以下标出 物,则范本量已被破坏,很很有已经是与溶血有机物光于,因很有已经对cf-NA测验无效的。辛运的是,争对低核酸水平和cf-NA特异形分离出和降钙素原检测,现实存在适合的化学制剂盒和技巧。Norgen供给低丰度DNA和RNA定 量化学制剂盒,迅敏度多达到1 pg/μL比率,甚至会更低。接着的图2屏幕上显示了差异已发现DNA选择量的qPCR统计图表,證明了这有一点。 只需在合适的荧光核酸染剂的輔助下,这样化学制剂盒能够与一点qPCR机系统一切选择。可使用改良的Quant-iTTM RiboGreen? RNA检测试剂盒来定量cfRNA,而类似地改良的Quant-iTTM PicoGreen? dsDNA试剂盒可 定量cf-DNA。请参阅附♍录以了解协议的修改内容。 Agilent生产的高灵敏度DNA试剂🧔盒可以检测低至5 pg/μL的DNA, 而他们的RNA 6000 Pico Kit 结合Bioanalyzer(图3)使用时,可以 检测到50 pg/μL的RNA。 Bioanalyzer示踪图还可以提供视觉定性 信息。纯样品只会在140-180 bp附近有一个峰,而含有gDNA污染 的样品则在较高bp范围内有第二个宽峰,如图4所示。
Figure 2꧙. 用Norgen的低丰度DNA参考值🌼采血管盒转换的主要性qPCR基线图。增加比较可观察到500 fg区间。
Figure 3. Bioanalyzer示踪图体现cf-RNA的高截获率(约1七个荧光单 位)(A,Norgen血浆/血清cfc-RNA一级纯化化学生化试剂盒),与cfRNA截获🐲率较低的RNA示踪图(约4个荧光组织)(B,竞争者敌手Q 循环法核酸检则化学生化试剂盒)🍷。
Figure 4. Bioanalyzer示踪图表明从Norgen的cf-DNA/cf-RNA储放管 中赚取的纯cf-DNA(蓝色系),经Norgen cf-DNA分离处理实验试剂盒纯化,以 及从家用血浆收集分液漏斗赚取的包含的gDNA环保问题的示踪图(👍红颜色)。污 染示踪图下cf-DNA的增添是因此组织溶解完时尽情释放的核小体。因此其 对应可靠,其是最先见的化学降解DNA内容之三。
Figure 5. 高色度核酸供试品的表示性Ct值/PCR键盘输入图
附录
而对于cf-NA酶联免疫法,建意修改游戏Quant-iTTM RiboGreen? RNA检查微生物培养基盒和Quant-iTTM PicoGreen? dsDNA检查微生物培养基盒的方 法是将发应图片缩放至20 μL,并在0.5 mL电子光学透明色管内开始。2,无需选用安利的萃取DMSO交易量的200倍兑水(在TE 中),往往设置成1000倍兑水。提拱的NA规定应按有以下证明准备好:1) 对于浓度范围从1 ng/μL到100 pg/μL:
将出具的100 μg/mL RNA规范标准单位的2 μL做好稀释工作至以后体积大概为100 μL,用无核酸酶水稀 释至以后盐浓度为2 μg/mL。这将应用于筹备 规范标准单位。1X TE (?L) | 2 ?g/mL RNA | 1000-fold Dilution of RiboGreen? (?L) | Final RNA Concentration |
0 | 10 | 10 | 1 ng/?L |
5 | 5 | 10 | 500 pg/?L |
7.5 | 2.5 | 10 | 250 pg/?L |
9 | 1 | 10 | 100 pg/?L |
2) 对于50 pg/μL到5 pg/μL的浓度:
将2 μg/mL溶剂的5 μL与95 μL核酸酶优质水希释,提升以后RNA稀硫酸浓度为100 ng/mL,第三需备低于的标准单位溶剂。自然,这也适 主要用于DNA的标准单位。不良反应混合型物由1μL样件、9 μL 1X TE和10μL RiboGreen?或PicoGreen?化学药品形成。1X TE (?L) | 2 ?g/mL RNA | 1000-fold Dilution of RiboGreen? (?L) | Final RNA Concentration |
0 | 10 | 10 | 1 ng/?L |
5 | 5 | 10 | 500 pg/?L |
7.5 | 2.5 | 10 | 250 pg/?L |
9 | 1 | 10 | 100 pg/?L |
3、血浆Small RNA-seq工作流程:
1、分类整理与维持
c♕f-DNA/cf-RNA Preservative Tube,cf-DNA/c f-RNA 维持管 (Cat. Dx69350, 69350)
在环境温度下储存 cf-RNA、cf-DNA 和 ct-DNA 将近30天
可以防止装运操作过程中的溶血
血浆利用率高
含有规定剂的玻璃钢保鲜剂,无DNA化学交联
与市售的cf-RNA和cf-DNA纯化方式方法兼容
保证代有CE-IVD身份认证的欧宝体育官方 版本升级
Norgen Biotek | Competitor 1 | |
高温动态平衡存储时限 | 30 Days | 7 Days |
溶血率 | 最小化 | 显著溶血 |
血浆回收体积 | ~5-6 mL | ~3-4 mL |
固定剂 | 不含 | 含有固定剂 |
2 、RNA 提取纯化
Plasma/Serum RNA Puri?cation Kit ,血浆/血清 RNA 纯化试剂盒 (Cat. 55000, 56100, 56200)
依照并过柱各个的RNA,究竟其粗细或GC分子量如此,不太老有误差值
Plasma/Serum Exosome Puri?cation and RNA Isolation Kit
血浆/ 血清外泌体纯化及 RNA 提取试剂盒 (Cat. 58300, 58500, 58600)
3 . NGS服务 (SMALL RNA 测序)
Library Preparation: Small RNA Library Prep Kit
文库制备: 小RNA文库制备试剂盒 (Cat. 63600)
测序
生物信息分析
4、无创产前检测NIPT,开放平台工作流程
1. 收集与保存
cf-DNA/cf-RNA Preservative Tube,cf-DNA/c f-RNA 保存管 (Cat. Dx69350, 69350)
Norgen Biotek | Competitor 1 | Competitor 2 | |
恒温存为间隔时间 | 30 days | 14 days | 最高 10 days |
溶血率 | 面值最小化 | 显著溶血 | 低溶血 |
血浆回收率 | ~5-6 mL*2 | ~3-4 mL*2 | ~5 mL*2 |
固定剂 | 不含 | 含固定剂 | 不含 |
References
a. Ward Gahlawat A, Lenhardt J, Witte T, et al. Evaluation of storage tubes for combined analysis of circulating nucleic acids in liquid biopsies. International Journal of Molecular Sciences. 2019;20(3):704. doi:10.3390/ijms20030704
b. Maass KK, Schad PS, Finster AM, et al. From sampling to sequencing: A liquid biopsy pre-analytic workflow to maximize multi-layer genomic information from a single tube. Cancers. 2021;13(12):3002. doi:10.3390/cancers13123002
2 . DNA提取纯化
Plasma/Serum Cell-Free Circulating DNA Puri?cation Kits 血浆/血清无细胞膜循环法DNA纯化化学试剂盒(Cat. 55500, 55100, 55600 and 55900)可以处理10μL到10 mL的血浆
Norgen Biotek | Competitor 1 | Competitor 2 | |
上样量 | 10 ?L - 10 mL | 1 mL - 10 mL | 3 mL to 10 mL |
洗脱体积 | 25 ?l - 50 ?l | 20 ?l - 80 ?l | 35 ?l |
填料树脂 | 专利碳化硅 | 硅胶 | 硅胶 |
需要预浓缩步骤吗? | No | Yes | No |
下游应用兼容性 | Yes | Yes | Yes |
整体优势 | Norgen使用碳化硅技术,可以捕 获低浓度的cf-DNA | 可以部分自动化 | 非常快速和简单的协 议 |
整体劣势 | 该实验试剂盒不掌握系统自动操作方法的特性。 Norgen的Plasma/Serum cfcDNA高纯化实验试剂盒(Cat. 68000)能构建电脑自动 化,一个较好的会选择。 | 使用二氧化硅,已被证明 能预先与高GC含量和高 分子量的DNA结合,造成 偏差。 | 使用二氧化硅,已被证明 能预先与高GC含量和高 分子量的DNA结合,造 成偏差。 |
3 、文库制备
Norgen不打造DNA的文库制 备制剂盒,所以,欧宝体育官方 的RNA纯化和DNA脱离制剂盒与一点采用全基 因组测序的商业运作文库提纯制剂盒兼容4 .测序和数据分析
拥有了注意好的DNA,能够 展开全 人类基因显性基因组测序来考察全部整个孕期宝宝人类基因显性基因组,以确定好需不需要有任意显性基因出错。 一些有重要性性的具体方法涵盖SNP分折和微阵列5、客户成功案例:
Alex Rolland: 使用外泌体 ct-DNA 改善癌症诊断
我的名字是Alex Rolland,我是Cancer Treatment Options and Management Inc.(CTOAM)和Liquid Biopsy Labs的联合创始人和首 席科学家。
个人小结一次欧宝体育官方 在Norgen欧宝体育官方 中发觉的优点:
从血官荣获高时产的血浆/血清
从孩子的导入微生物培养基盒中赢得高总产量的胃癌/胚 泡有关系的ct-DNA
案例研究
案例1
1个小肠癌患有在其肿癌DNA测序中发现了PRKDC(肿癌抑 制什么是基因)的有一个未决进化体(VUS)。欧宝体育官方 对其进行了有一个应用于 计算出来机的研究研究分析/字段传统性研究研究分析,的结果提示 这一进化体很可 能是致病性的。法律事实单位证明,欧宝体育官方 接着随后便用它来在线检测此患有的早 期恶变原因,并评价控制目的。案例2
该患者患有晚期乳腺癌,欧宝体育官方 的测序结果显示其PIK3CA基 因发生了突变。当时,用于治疗特定类型乳腺癌的药物 Alpelisib在加拿大尚未获得批准,因此欧宝体育官方 联系了药品制造 商并说服他们提供免费的药物,同时从加拿大卫生部获得 了同情使用权,并使用ct-DNA监测患者的治疗反应。不幸 的是,在这种情况下,患者只能短暂地耐受药物,并不得 不停止使用。正如您所看到的,欧宝体育官方 的测试显示了未经有 益治疗的ct-DNA增加。
Figure 2. 从爱美者全血中提取的PIK3CA P1047L外泌体DNA量。粗差线标识95%置信区段(CI)真实的科学家,真实的故事,真实的成功!
一、尿液收集&保存
URINE COLLECTION AND PRESERVATION TUBES 尿液浑浊持续与保存图片管 (CAT . 18116 , 18120, 18111, 18129)简单且快速地保存尿液样本
Figure 1. Norgen的的尿液保留剂中RNA的维持性
欧宝体育官方 信息:
Urine Collection and Preservation Tubes | |
1 Tube, 50 Tubes | Cat. 18116, 18118 (5 cc) |
1 Tube, 50 Tubes | Cat. 18120, 18122 (15 cc) |
1 Tube, 50 Tubes | Cat. 18111, 18113 (50 cc) |
1 Cup | Cat. 18129 (120 cc) |
1 Tube, 50 Tubes | Cat. 18124, 18126 (防腐剂-单卖) |
a. cf-RNA 提取纯化
URINE CELL-FREE CIRCULATING RNA PURIFICATION KITS
小便无上皮细胞循环系统RNA纯化采血管盒(CAT. 56900, 57000, 57100)25 - 30 min 添加纯化高安全性能量 RNA
纯化的RNA支持于一些上中游使用,包涵Small RNA测序
分离所有大小的循环和外泌体RNA,包括microRNA
Figure 1. 一直同尿体型中纯化无细胞核循环往复RNA和外泌体RNA。
欧宝体育官方 信息:
Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kits | |
50 Preps (Mini) | Cat. 56900 |
20 Preps (Midi) | Cat. 57000 |
10 Preps (Maxi) | Cat. 57100 |
URINE EXOSOME PURIFICATION AND RNA I SOL ATION KITS
尿夜外泌体纯化和RNA分离处理微生物培养基盒 (CAT. 58400, 58700, 58800)a. 不论什么面积大小或GC分量,都要以紧密联系和冲洗掉全部的RNA,找不到误差值 b. 分离出来各个规模的外泌体RNA,有microRNA c. 可调的小便放入量(250 ?L至30 mL) d. 不需苯酚提纯,血清酶K清理或各种载体RNAe. 不需要耗时的超速离心,过滤或特殊注射器
f. 不需要沉淀试剂或过夜孵育
g. 与任何物种的尿液兼容
h. 纯外泌体被纯化并且不含任何其他RNA结合蛋白
i. 纯化鉴于用到Norgen专有不饱和树脂转移基本材料的飞速转动柱层析
完善尿外泌体的纯化和聚集,满足了的功能探索业务需求
Figure 1. 从来都不同排尿量中纯化的外泌体中离RNA。 选择Norgen的尿里外泌体纯化和RNA拆分采血管盒(Cat. 58800)选择相似的采血管盒绝不同尿液中纯化外泌体,并分 离RNA。然后,选择拆分的RNA的2微升当做RT-qPCR现象 中的钢板,监测拆分的尿外泌体miR-30a的扩张情形。(A) 时间推移欧宝体育官方 的样品插入量的曾加,尿外泌体miR-30a呈线型变低趋 势。B)尿外泌体miR-30a的比量体现出优秀的线型干系, 环保再生资源回产出率少于90%。
欧宝体育官方 信息:
Urine Exosome Purification and RNA Isolation Kits | |
50 Preps (Mini) | Cat. 58400 |
25 Preps (Midi) | Cat. 58700 |
15 Preps (Maxi) | Cat. 58800 |
b. cf-DNA 提取纯化
URINE CELL-FREE CIRCULATING DNA PURIFICATION KITS
尿里无血细胞巡环DNA纯化微生物培养基盒(CAT. 56600, 56700, 56800)溶合病毒样本DNA 适宜于不同的体积大概的小便输出(250 ?L - 30 mL) 将嵌套循环DNA高浓到灵活多变的过柱质量分数区域内(50 ?L - 100 ?L) 提取的内部外循坏DNA,无仰溶液剂 15-20min,即得高品性能DNA 与Norgen的尿水另存剂和各种市售尿水另存剂兼容 纯化依据在使用Norgen专有的树脂胶拆分基本材料的翻转视频柱色谱法。从新鲜、保存或冷冻的尿液样本,分离出所有大小的循环DNA
适用Norgen的小便组织细胞游离态DNA纯化Maxi微生物培养基盒(规格型号56800), 从10 mL、20 mL和30 mL小便中分发型离DNA。在20 ?L的qPCR想法中 适用不一样体型大小大概的洗刷物(2、4和8 ?L),看Ct值会不有减掉。随 着模版量的加大,Ct值的加大将清晰是因为样例中发生PCR阻止剂。 在qPCR中适用不一样洗刷工件积大概算作模版并不导致由qPCR提取的Ct 值。观点上,Ct值取向于跟随着PCR读取体型大小大概的加大而减掉,是因为使 用Norgen微生物培养基盒纯化的小便中的DNA可含一般 发生于小便中的常用 阻止剂。
Urine Cell-Free Circulating DNA Purification Kits | |
50 Preps (Mini) | Cat. 56600 |
20 Preps (Midi) | Cat. 56700 |
10 Preps (Maxi) | Cat. 56800 |
2、尿液 Small RNA- Seq 工作流程
1、 收集与保存
Urine Collection and Preservation Devices - 5cc, 15cc, 50cc, 120cc, single dose,Norgen Biotek | Competitor 1 | Competitor 2 | |
室温保存时长 | 2 年+ | 7 天 | 30 天+ |
使用简便 | Yes | No | No |
保存的生物标志物 | cf-DNA, cf-RNA, exosomes, proteins | DNA and RNA | DNA and RNA |
2、RNA转化成纯化
Urine Cell-Free Circulating RNA Puri?cation Kit,
的尿液无肿瘤细胞不断循环RNA纯化微生物培养基盒 (Cat. 56900, 57000, 57100)
利于Norgen的专有环氧树脂栽培基质纯化癌细胞外巡环RNA
分开因此核蛋白结合在一起的不断循环cf-RNA,还包括内部外囊泡的RNA
而是尺寸或GC占比,都能结合在一起和冲洗掉拥有RNA,没偏激
不安全使用的载体RNA
不用到风险化学上品,如苯酚或氯仿
可不可以进行处理250 ?L到30 mL的尿中
纯化的RNA与在下游用(如qPCR、NGS、微阵列等)兼容。
Urine Exosome Puri?cation and RNA Isolation Kit,
尿夜外泌体纯化和RNA分离法制剂盒 (Cat. 58400, 58700, 58800)
3 . NGS的服务 (SMALL RNA 测序) Library Preparation: Small RNA Library Prep Kit
文库制备: 小RNA文库制备试剂盒 (Cat. 63600)
而对低好手机输入的RNA参与了调优,还是比较是位于体液的RNA
有4七个indices 的可以选择性
最快和简单的作业流量
测序
Illumina 网站
生物工程个人信息深入分析
经过菌物问题学解析来体谅转录后政策调控
体检文化差异体现潜在现新的动物标准物
完整版的申请书和立刻可刊发的图文消息数据文件
三、稿件 / PUBLICATIONS
1. From Sampling To Sequencing: A Liquid Biopsy Pre-Analytic Workflow To Maximize Multi-Layer Genomic Information From A Single Tube //www.mdpi.com/2072- 6694/13/12/3002
2 . Evaluation of Storage Tubes for Combined Analysis of Circulating Nucleic Acids in Liquid Biopsies //www. mdpi.com/1422-0067/20/3/704
3 . Comprehensive evaluation of methods to isolate, quantify, and characterize circulating cell-free DNA from small volumes of plasma //link.springer.com/article/10.1007/s00216-015-8846-4
4 . Effect of microRNA GC Content on RNA Purification Efficiency (App Note made by Norgen) //norgenbiotek. com/sites/default/files/resources/plasma_serum_circulating_ and_exosomal_rna_purification_kit_slurry_format_effect_of_ microrna_gc_content_on_rna_purification_efficiency_application_notes_465_0.pdf
5 . Comparison of Four Commercial Kits for Isolation of Urinary Cell-Free DNA and Sample Storage Conditions // www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7236016/ 6 . Measurement Biases Distort Cell-Free DNA Fragmentation Profiles and Define the Sensitivity of Metagenomic Cell-Free DNA Sequencing Assays //academic.oup.com/clinchem/ article/68/1/163/6410769?login=false
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